Bio-informaticus Bas Dutilh heeft samen met andere onderzoekers een virus ontdekt dat bij veel mensen in de darmen voorkomt. Wat voor rol deze bacteriofaag speelt, is nog niet bekend. Wel wordt langzaam duidelijk dat de virale darmflora niet zo veel verschilt tussen mensen als eerder werd aangenomen.
Bij darmflora denken de meeste mensen met name aan bacteriën en een restje schimmels. Virussen zijn tot nu toe onderbelicht gebleven, weet bio-informaticus Bas Dutilh (Radboudumc). ‘Sinds een jaar of 10 is men vooral bezig om het genetische materiaal van bacteriën in de darmen te ontrafelen, de virussen krijgen veel minder de aandacht.’ In dat kader ontwikkelde hij computertechnologie waarmee hij genetische data kan analyseren. Die data zijn afkomstig van gesequencet fecaal materiaal en bevatten genetische informatie over de gehele darmflora, ook wel bekend als het metagenoom. Hij vergeleek allerlei stukjes viraal DNA uit verschillende fecale monsters met elkaar en kon daaruit een genetische code samenstellen. Experimentele virologen gingen vervolgens na of dit digitaal gereconstrueerde virus ook daadwerkelijk in de monsters voorkwam: dat bleek het geval. Een virus dat nog niet eerder beschreven werd, kreeg de naam crAssphage, naar de cross-assembly software die gebruikt is bij het onderzoek.
Lees hier het volledige artikel.