Sclerodermie is evenals SLE een auto-immuun- ziekte die onder reuma valt. Dat houdt in dat het afweersysteem zich tegen lichaamseigen bestanddelen richt. Bij sclerodermie kunnen alle delen van het lichaam betrokken raken in het ziekteproces: de spieren, gewrichten en inwendige organen, met name de slokdarm, maag, darmen, de longen, het hart en de nieren.